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【廣東省,中山市】中山大學(xué)中山眼科中心單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組個(gè)性化數(shù)據(jù)線(xiàn)上分析系統(tǒng)項(xiàng)目
發(fā)布時(shí)間 2021-01-28 截止日期 立即查看
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招投標(biāo)詳情


中山大學(xué)中山眼科中心就單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組個(gè)性化數(shù)據(jù)線(xiàn)上分析系統(tǒng)項(xiàng)目組織單一來(lái)源采購(gòu),評(píng)標(biāo)工作已經(jīng)結(jié)束,成交結(jié)果如下:

一、項(xiàng)目名稱(chēng):中山大學(xué)中山眼科中心單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組個(gè)性化數(shù)據(jù)線(xiàn)上分析系統(tǒng)

二、中標(biāo)(成交)信息

供應(yīng)商名稱(chēng):***

供應(yīng)商地址:***市***區(qū)生命科***路29號(hào)1B316-12

中標(biāo)(成交)金額****元整(120,000

三、主要標(biāo)的信息

編號(hào)***e=“mso-bidi-font-weight: normal“>

功能模塊

描述

1

細(xì)胞屬性表

存儲(chǔ)、顯示細(xì)胞矩陣。

2

基因?qū)傩员?/span>

存儲(chǔ)、顯示基因表達(dá)信息。

3

樣本屬性表

存儲(chǔ)、顯示樣本分組信息。

4

任務(wù)模塊

顯示任務(wù)、查看任務(wù)結(jié)果等。

5

圖庫(kù)模塊

任務(wù)中產(chǎn)生的圖永久存儲(chǔ)。

6

報(bào)告模塊

交付標(biāo)準(zhǔn)流程報(bào)告。

7

基因集

Marker基因。

8

細(xì)胞集

篩選過(guò)的細(xì)胞存儲(chǔ)顯示。

9

細(xì)胞定型

查看marker基因集聚類(lèi)表達(dá)熱圖。

10

定型分組

存儲(chǔ)、顯示自定義分組信息。

11

樣本分組

存儲(chǔ)、合并、顯示自定義分組信息。

12

個(gè)人中心

修改密碼、樣本信息、幫組文檔等信息。

13

多級(jí)賬戶(hù)

多個(gè)賬戶(hù)可合并在一個(gè)賬戶(hù)里面管理。

14

表格工具

15

選擇

選擇數(shù)據(jù)信息,正選、反選。

16

顯示列配置

顯示想要看到的列,隱藏不想看到列。

17

固定列

固定顯示某一列或某多列。

18

復(fù)制列

復(fù)制某一列信息,可更改列內(nèi)容。

19

篩選列

篩選某一列中內(nèi)容,如大于100的數(shù)值、模糊某一列的字符。

20

保存集合

保存所選結(jié)果到細(xì)胞集、基因集。

細(xì)胞工具:

21

小提琴QC

使用小提琴圖展示各類(lèi)細(xì)胞的QC分布。

22

Tsne/umap

tsne/umap/pca降維散點(diǎn)圖上顯示樣本、聚類(lèi)、QC等信息。

23

差異基因分析

指定不同類(lèi)或者不同樣本進(jìn)行差異基因分析,對(duì)照組為空時(shí),默認(rèn)和處理組之外的所有細(xì)胞進(jìn)行差異比較分析。

24

細(xì)胞異質(zhì)性差異分析

計(jì)算亞群中所有細(xì)胞兩兩間的歐式距離并以箱線(xiàn)圖的形式表示其分布,距離分布越高則表示該亞群細(xì)胞異質(zhì)性越高。

25

細(xì)胞比例差異分析

比較樣本或者分組之間各類(lèi)細(xì)胞比例差異,尋找特有細(xì)胞亞群。

26

細(xì)胞軌跡分析

對(duì)選中的細(xì)胞進(jìn)行偽時(shí)間排序,構(gòu)建細(xì)胞擬時(shí)間序列軌跡,同時(shí)尋找與擬時(shí)間變化顯著相關(guān)的基因。

27

基因表達(dá)篩選

根據(jù)基因表達(dá)值篩選細(xì)胞。

28

聚類(lèi)

重新聚類(lèi)

基因工具:

29

GO富集分析

使用clusterProfiler對(duì)選中基因集進(jìn)行GO富集分析。

30

KEGG富集分析

使用clusterProfiler對(duì)選中基因集進(jìn)行Patahway富集分析。

31

Marker基因表達(dá)熱圖

使用熱圖展示所選基因在各個(gè)亞群或者樣本中的表達(dá)情況。

32

Marker基因表達(dá)小提琴圖

使用小提琴圖展示所選基因在各個(gè)亞群或者樣本中的表達(dá)分布。

33

Marker基因表達(dá)散點(diǎn)圖

使用降維后的細(xì)胞散點(diǎn)圖展示所選基因在每個(gè)細(xì)胞中的表達(dá)情況。

34

基因平均表達(dá)熱圖

使用熱圖快速展示所選基因在各個(gè)亞群或者樣本中的平均表達(dá)情況。

四、評(píng)審專(zhuān)家(單一來(lái)源采購(gòu)人員)名單:

梁曉松、甄利雙、朱偉團(tuán)、李翔,吳成、肖柳容、張草賢(采購(gòu)人代表)

五、公告期限

自本公告發(fā)布之日起3個(gè)工作日。

凡對(duì)本次公告內(nèi)容提出詢(xún)問(wèn),請(qǐng)按以下方式聯(lián)系。

聯(lián)系方式:

信息科肖柳容 TEL020***

監(jiān)察室敖老師 TEL020***

中山大學(xué)中山眼科中心

2021128

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