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*** 無***

*** 無***

*** 1）全基因組重測序：對100個動物樣本進行基因組重測序。 a.要求每個個體測序深度為10×，每個樣品產(chǎn)生不低于10.5G數(shù)據(jù); b. 測序得到的reads質(zhì)量Q（-10log10(P)，其中P為Phred質(zhì)量評分）應(yīng)大于20；Q（該reads所有堿基質(zhì)量值的平均值）大于30的部分應(yīng)占總reads質(zhì)量85%以上；c.所有的reads的長度應(yīng)一致，不一致長度的reads占總體reads的占比最大不得超過95%；d.reads中如果含有接頭則需要修剪接頭，同時對低質(zhì)量堿基部分也進行修剪，在修剪完成后，reads的長度仍保留其原有長度的80%以上，該reads予以保留； e.樣品測序數(shù)據(jù)中GC含量應(yīng)在40%-45%范圍內(nèi)；f.測序結(jié)果中重復(fù)序列reads占比不得超過20%，10次以上重復(fù)的序列在所有reads中占比不得超過10%。 2）變異檢測分析：根據(jù)測序數(shù)據(jù)，對每個樣本進行基因組變異信息（SNP、InDel）分析。 3）品種特異位點基因挖掘：根據(jù)個體基因型數(shù)據(jù)及表型信息，進行品種特異性位點基因挖掘。結(jié)合樣本品種信息和基因型數(shù)據(jù)，進行生物信息學(xué)分析，挖掘性狀關(guān)聯(lián)位點，測試并優(yōu)化位點集。 4）品種鑒定芯片設(shè)計：基于基因組變異信息和功能位點，篩選和優(yōu)化位點集，設(shè)計20K密度品種鑒定芯片。 a.位點數(shù)目：不少于2萬個SNP位點；b.測序深度：SNP位點平均測序深度≥100X；c.數(shù)據(jù)質(zhì)量：位點檢出率＞95%（≥5X）、樣本檢出率＞95%。 5）品種鑒定分析：基于芯片數(shù)據(jù)，搭建品種純種參考庫，對200個待測樣本進行品種鑒定分析。對待測樣本進行芯片檢測、數(shù)據(jù)質(zhì)控和血統(tǒng)含量分析（包括數(shù)據(jù)和可視化結(jié)果）。 6）售后由專門技術(shù)對接，對后期分析作圖提供專業(yè)化指導(dǎo)和協(xié)助。***